VU Medicinos fakulteto autoriaus 'Mindaugas Morkūnas' publikacijų sąrašas

2024
1 Stulpinas, Rokas; Morkūnas, Mindaugas; Rasmusson, Allan; Drachneris, Julius; Augulis, Renaldas; Kielaitė-Gulla, Aistė; Strupas, Kęstutis; Laurinavičius, Arvydas. Improving HCC prognostic models after liver resection by AI-extracted tissue fiber framework analytics // Cancers. Basel : MDPI AG. eISSN 2072-6694. 2024, vol. 16, iss. 1, art. no. 106, p. [1-18]. DOI: 10.3390/cancers16010106. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science), Scopus]
2 Drachneris, Julius; Morkūnas, Mindaugas; Fabijonavičius, Mantas; Čekauskas, Albertas; Jankevičius, Feliksas; Laurinavičius, Arvydas. Prediction of non-muscle invasive papillary urothelial carcinoma relapse from hematoxylin-eosin images using deep multiple instance learning in patients treated with Bacille Calmette–Guérin immunotherapy // Biomedicines. Basel : MDPI. ISSN 2227-9059. 2024, vol. 12, iss. 2, art. no. 360, p. [1-15]. DOI: 10.3390/biomedicines12020360. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science), Scopus]
3 Drachneris, Julius; Morkūnas, Mindaugas; Fabijonavičius, Mantas; Čekauskas, Albertas; Jankevičius, Feliksas; Laurinavičius, Arvydas. Spatial distribution of macrophage and lymphocyte subtypes within tumor microenvironment to predict recurrence of non-muscle-invasive papillary urothelial carcinoma after BCG immunotherapy // International journal of molecular sciences. Basel : MDPI. eISSN 1422-0067. 2024, vol. 25, iss. 9, art. no. 4776, p. [1-12]. DOI: 10.3390/ijms25094776. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science), Scopus]

2023
1 Drachneris, Julius; Rasmusson, Allan; Morkūnas, Mindaugas; Fabijonavičius, Mantas; Čekauskas, Albertas; Jankevičius, Feliksas; Laurinavičius, Arvydas. CD8+ cell density gradient across the tumor epithelium-stromal interface of non-muscle invasive papillary urothelial carcinoma predicts recurrence-free survival after BCG immunotherapy // Cancers. Basel : MDPI. eISSN 2072-6694. 2023, vol. 15, iss. 4, art. no. 1205, p. [1-12]. DOI: 10.3390/cancers15041205. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science), Scopus]
2 Besusparis, Justinas; Morkūnas, Mindaugas; Laurinavičius, Arvydas. A spatially guided machine-learning method to classify and quantify glomerular patterns of injury in histology images // Journal of imaging. Basel : MDPI. eISSN 2313-433X. 2023, vol. 9, iss. 10, art. no. 220, p. [1-20]. DOI: 10.3390/jimaging9100220. [DB: Emerging Sources Citation Index (Web of Science), Scopus]

2021
1 Morkūnas, Mindaugas; Žilėnaitė, Dovilė; Laurinavičienė, Aida; Treigys, Povilas; Laurinavičius, Arvydas. Tumor collagen framework from bright-field histology images predicts overall survival of breast carcinoma patients // Scientific reports. Berlin : Nature research. ISSN 2045-2322. 2021, vol. 11, no. 1, art. no. 15474, p. [1-13]. DOI: 10.1038/s41598-021-94862-6. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science), Scopus, MEDLINE] [IF: 4.997; AIF: 7.694; Q2 (2021 InCities JCR SCIE)]

2018
1 Morkūnas, Mindaugas; Treigys, Povilas; Bernatavičienė, Jolita; Laurinavičius, Arvydas; Korvel, Gražina. Machine learning based classification of colorectal cancer tumour tissue in whole-slide images // Informatica. Vilnius : Vilniaus universiteto Matematikos ir informatikos institutas. ISSN 0868-4952. eISSN 1822-8844. 2018, vol. 29, no. 1, p. 75-90. DOI: 10.15388/Informatica.2018.158. [DB: Zentralblatt MATH (zbMATH), MathSciNet, Scopus, Science Citation Index Expanded (Web of Science)] [IF: 1.928; AIF: 2.188; Q1 (2018 InCities JCR SCIE)]
2 Morkūnas, Mindaugas; Treigys, Povilas; Laurinavičius, Arvydas. Deep learning-based method for quantitative collagen framework analysis in routine pathology images // DAMSS 2018 : 10th international workshop on "Data analysis methods for software systems", Druskininkai, Lithuania, November 29 - December 1, 2018 : [abstract book]. Vilnius : Vilniaus universitetas, 2018. ISBN 9786090700433. p. 62. Prieiga per internetą: <https://www.mii.lt/datamss/files/DAMSS_2018_1.pdf> [žiūrėta 2018-12-10].

2017
1 Morkūnas, Mindaugas; Treigys, Povilas; Bernatavičienė, Jolita; Laurinavičius, Arvydas. Impact of colour on colorectal cancer tissue classification in hematoxylin and eosin stained histological images // 9th International workshop on Data Analysis Methods for Software Systems (DAMSS), Druskininkai, Lithuania, November 30 - December 2, 2017. Vilnius : Vilniaus universitetas, 2017. ISBN 9789986680642. p. 35-36. Prieiga per internetą: <https://www.mii.lt/datamss/files/liks_mii_drusk_2017.pdf> [žiūrėta 2017-12-12].

2016
1 Morkūnas, Mindaugas; Treigys, Povilas; Laurinavičius, Arvydas. An overview of methods to spatially map intra-tumor genetic heterogeneity in whole slide pathology images // Data analysis methods for software systems : 8th international workshop on data analysis methods for software systems, Druskininkai, December 1-3, 2016. Vilnius : Vilniaus universiteto leidykla, 2016. ISBN 9789986680611. p. 42-43. Prieiga per internetą: <https://www.mii.lt/datamss/files/liks_mii_drusk_2016_abstract_el_v_.pdf> [žiūrėta 2016-12-27].

2007
1 Sereikaitė, Jolanta; Statkutė, Alina; Morkūnas, Mindaugas (dailininkas); Radzevičius, Kostas; Borromeo, Vitaliano; Secchi, Camillo; Bumelis, Vladas Algirdas. Production of recombinant mink growth hormone in E. coli // Applied microbiology and biotechnology. Berlin : Springer. ISSN 0175-7598. 2007, Vol 74, no 2, p. 316-323. DOI: 10.1007/s00253-006-0673-2. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science), SpringerLink] [IF: 2.475; AIF: 2.934; Q2 (2007 InCities JCR SCIE)]

2006
1 Mažeika, Darius; Morkūnas, Mindaugas. Mutantinio trigerinio faktoriaus klonavimas // Bioinžinerija ir bioinformatika (2006 m. balandžio 6 d.). Fizika ir fizinė kompiuterija (2006 m. balandžio 7 d.): 9-osios Lietuvos jaunųjų mokslininkų konferencijos "Mokslas - Lietuvos ateitis" medžiaga. Vilnius : Technika, 2006. ISBN 9986059895. p. 75-82.
2 Sereikaitė, Jolanta; Statkutė, Alina; Morkūnas, Mindaugas; Borromeo, Vitaliano; Secchi, Camillo; Bumelis, Vladas Algirdas. Production of recombinant mink growth hormone in E. coli // Microbial cell factories. London : Biomed Central. ISSN 1475-2859. 2006, Vol. 5, suppl. 1, p. 15. DOI: 10.1186/1475-2859-5-S1-P15. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science)]
3 Ališauskaitė, Saulė; Morkūnas, Mindaugas; Mažeika, Darius; Sereikaitė, Jolanta; Bumelis, Vladas Algirdas. Modifikuotas PGR metodas daugybinių mutacijų įvedimui // Biochemija: mokslas ir žinių visuomenė : Lietuvos biochemikų draugijos IX-asis suvažiavimas-konferencija : 2006 m. birželio mėn. 16-18 d., Tolieja (Molėtų raj.), Lietuva. Tolieja. 2006, p. 17.
4 Morkūnas, Mindaugas; Mažeika, Darius; Ališauskaitė, Saulė. Mutantinio trigerinio faktoriaus klonavimas ir koekspresija su rekombinantiniu audinės augimo hormonu // Biochemija: mokslas ir žinių visuomenė: Lietuvos biochemikų draugijos IX-asis suvažiavimas-konferencija: 2006 m. birželio mėn. 16-18 d., Tolieja (Molėtų raj.), Lietuva. Tolieja. 2006, p. 56.
5 Kulys, Juozas (redaktorius); Juška, Alfonsas (redaktorius); Gedminienė, Genovaitė (redaktorius); Morkūnas, Mindaugas (redaktorius); Česnys, Antanas (redaktorius); Kerienė, Jadvyga Regina (sudarytojas). Bioinžinerija ir bioinformatika (2006 m. balandžio 6 d.). Fizika ir fizinė kompiuterija (2006 m. balandžio 7 d.) : 9-osios Lietuvos jaunųjų mokslininkų konferencijos "Mokslas - Lietuvos ateitis" medžiaga / Vilniaus Gedimino technikos universitetas ; redakcinė kolegija: J. Kulys, A. Juška, G. Gedminienė, M. Morkūnas, A. Česnys, A. Urbelis ; sudarė J. Kerienė. Vilnius : Technika, 2006. 231 p. ISBN 9986059895.

2005
1 Morkūnas, Mindaugas; Ališauskaitė, Saulė; Sereikaitė, Jolanta; Bumelis, Vladas Algirdas. Influence of growth limiting factors on recombinant growth hormone expression in E.coli // Journal of Biotechnology : Bringing Genomes to Life : abstracts of the 12th European Congress on Biotechnology. August 21-24, 2005 Copenhagen, Denmark. Amsterdam : Elsevier. ISSN 0168-1656. 2005, Vol. 118, suppl. 1, p. 83. [DB: Conference Proceedings Citation Index - Science (Web of Science), Science Citation Index Expanded (Web of Science)] [IF: 2.687; AIF: 2.795; Q2 (2005 InCities JCR SCIE)]
2 Meškauskas, Audrius; Gedminienė, Genovaitė; Jaskelevičienė, Bronė; Morkūnas, Mindaugas; Bumelienė, Žana; Sereikaitė, Jolanta; Bumelis, Vladas Algirdas. Prediction of Pseudomonas putida growth during bath fermentation by controlling acid production rate // Biologia. Bratislava : Slovak Academy of Sciences. ISSN 0006-3088. 2005, Vol. 60, no. 3, p. 259-265. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science)] [IF: 0.240; AIF: 2.587; Q4 (2005 InCities JCR SCIE)]
3 Kerienė, Jadvyga-Regina (sudarytojas); Kulys, Juozas (redaktorius); Juška, Alfonsas (redaktorius); Gedminienė, Genovaitė (redaktorius); Morkūnas, Mindaugas (redaktorius); Česnys, Antanas (redaktorius); Urbelis, Antanas (redaktorius). 8-osios Lietuvos jaunųjų mokslininkų konferencijos "Lietuva be mokslo - Lietuva be ateities" medžiaga : bioinžinerija ir bioinformatika (2005 m. balandžio 14 d.) : fizika ir fizinė kompiuterija (2005 m. balandžio 8 d.) / sudarytoja J. Kerienė ; red. kolegija: J. Kulys, A. Juška, G. Gedminienė, M. Morkūnas, A. Česnys, A. Urbelis. Vilnius : Technika, 2005. 194 p. ISBN 9986058538.
4 Puplevičius, Mindaugas; Morkūnas, Mindaugas. Biosintezės sąlygų įtaka rekombinantinio audinės augimo hormono agregacijai = Biosynthesis Prameters Influence on Recombinant Mink Growth Hormone Aggregation // 8-osios Lietuvos jaunųjų mokslininkų konferencijos "Lietuva be mokslo - Lietuva be ateities" medžiaga : bioinžinerija ir bioinformatika (2005 m. balandžio 14 d.), fizika ir fizinė kompiuterija (2005 m. balandžio 8 d.). Vilnius : Technika, 2005. ISBN 9986058538. p. 83-88.

2004
1 Morkūnas, Mindaugas; Gedminienė, Genovaitė; Sereikaitė, Jolanta; Bumelienė, Žana; Bumelis, Vladas Algirdas. Jaučio augimo hormono aukšto lygio ekspresija E.COLI ląstelėse // Biochemija mokslų sandūroje : VIII suvažiavimas-konferencija, 2004 m. birželio 18-20 d. Tolieja (Molėtų raj.). Konferencija skiriama pagrindinės Lietuvos biochemikų "kalvės" - Vilniaus universiteto - 425 metų jubiliejui. Vilnius : VDU, 2004. ISBN 9986196485. p. 54.
2 Sereikaitė, Jolanta; Bajorūnaitė, Eglė; Bumelienė, Žana; Gedminienė, Genovaitė; Morkūnas, Mindaugas; Bumelis, Vladas Algirdas. Žmogaus augimo hormono sąveikos su Kongo raudonuoju tyrimas // Biochemija mokslų sandūroje : VIII suvažiavimas-konferencija, 2004 m. birželio 18-20 d. Tolieja (Molėtų raj.). Konferencija skiriama pagrindinės Lietuvos biochemikų "kalvės" - Vilniaus universiteto - 425 metų jubiliejui. Vilnius : VDU, 2004. ISBN 9986196485. p. 65.
3 Morkūnas, Mindaugas; Gedminienė, Genovaitė; Sereikaitė, Jolanta; Bumelienė, Žana; Bumelis, Vladas Algirdas. High level expression of recombinant bovine growth hormone = Jaučio augimo hormono aukšto lygio ekspresija E. coli ląstelėse // Biologija. Vilnius : Lietuvos mokslų akademijos leidykla. ISSN 1392-0146. 2004, Nr. 2 (1 priedas), p. 82-84.
4 Sereikaitė, Jolanta; Bajorūnaitė, E; Bumelienė, Ž; Morkūnas, M.; Gedminienė, G; Bumelis, Vladas Algirdas. Dimerization of human growth hormone in the presence of Congo red = Žmogaus augimo hormono dimerizacija esant Kongo raudonajam // Biologija. ISSN 1392-0146. 2004, Nr. 2 (1 priedas), p. 70-72.

2003
1 Smirnovas, Vytautas; Ališauskaitė, Saulė; Morkūnas, Mindaugas. Rekombinantiniai augimo hormonai. Kiaulės augimo hormono ekspresija ir pirminis gryninimas // Šeštosios Lietuvos jaunųjų mokslininkų konferencijos "Lietuva be mokslo - Lietuva be ateities", medžiaga : bioinžinerija ir bioinformatika (2003 m. balandžio 17 d.). Fizika ir fizinė kompiuterija (2003 m. balandžio 18 d.). Vilnius : Technika, 2003. ISBN 996056195. p. 46-51.

2002
1 Morkūnas, Mindaugas. Šaperonų koekspresijos vektoriai = Chaperone coexpresion vectors // Penktosios Lietuvos jaunųjų mokslininkų konferencijos "Lietuva be mokslo-Lietuva be ateities", įvykusios Vilniuje 2002 m. balandžio 18-19 d., medžiaga : bioinžinerija ir bioinformatika, fizika ir fizinė kompiuterija. Vilnius : Technika, 2002. ISBN 9986055210. p. 5-12.