VU Medicinos fakulteto autoriaus 'Dovilė Žilėnaitė-Petrulaitienė' publikacijų sąrašas

2026
1 Fabijonavičius, Mantas; Garnelytė, Aušra; Žilėnaitė-Petrulaitienė, Dovilė; Rasmusson, Allan; Drachneris, Julius; Čekauskas, Albertas; Jankevičius, Feliksas; Laurinavičius, Arvydas. Spatially-resolved CD8+ and CD34+ computational immunohistochemistry indicators improve post-nephrectomy risk stratification in clear cell renal cell carcinoma // Human pathology. Philadelphia : Elsevier. ISSN 0046-8177. eISSN 1532-8392. 2026, vol. 173, art. no 106114, p. [1-12]. DOI: 10.1016/j.humpath.2026.106114. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science), Scopus]
2 Žilėnaitė-Petrulaitienė, Dovilė (tyrėjas). ONCOINTEGRA: skaitmeninės patologijos ir klinikinių duomenų rinkinys (v1) = ONCOINTEGRA: Digital Pathology and Clinical Dataset (v1). Vilnius, 2026. 9 failai. DOI: 10.18279/MIDAS.555180.
3 Witowski, Jan; Zeng, Ken G.; Cappadona, Joseph; Elayoubi, Jailan; Choucair, Khalil; Chiru, Elena Diana; Chan, Nancy; Kang, Young-Joon; Howard, Frederick; Ostrovnaya, Irina; Fernandez-Granda, Carlos; Schnabel, Freya; Steinsnyder, Zoe; Ozerdem, Ugur; Liu, Kangning; Abdulsattar, Waleed; Zong, Yu; Daoud, Lina; Beydoun, Rafic; Saad, Anas M.; Thakore, Nitya; Sadic, Mohammad; Yeung, Frank; Liu, Elisa; Hill, Theodore; Swett, Benjamin; Rigau, Danielle; Clayburn, Andrew J.; Speirs, Valerie; Vetter, Marcus; Sojak, Lina; Muenst, Simone; Baumhoer, Daniel; Pan, Jia-Wern; Makmur, Haslina; Teo, Soo-Hwang; Pak, Linda M.; Angel, Victor; Žilėnaitė-Petrulaitienė, Dovilė; Laurinavičius, Arvydas; Klar, Natalie; Piening, Brian D.; Bifulco, Carlo; Jun, Sun-Young; Yi, Jae Pak; Lim, Su Hyun; Brufsky, Adam; Esteva, Francisco J.; Pusztai, Lajos; LeCun, Yann; Geras, Krzysztof J. Multi-modal AI for comprehensive breast cancer prognostication // Nature Communications. Berlin : Nature Portfolio. eISSN 2041-1723. 2026, vol. 17, iss. 1, art. no. 5879, p. [1-16]. DOI: 10.1038/s41467-026-73088-y. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science), Scopus]

2025
1 Žilėnaitė-Petrulaitienė, Dovilė; Rasmusson, Allan; Besusparis, Justinas; Valkiūnienė, Rūta Barbora; Augulis, Renaldas; Laurinavičienė, Aida; Plancoulaine, Benoit; Petkevičius, Linas; Laurinavičius, Arvydas. Intratumoral heterogeneity of Ki67 proliferation index outperforms conventional immunohistochemistry prognostic factors in estrogen receptor-positive HER2-negative breast cancer // Virchows archiv. New York : Springer. ISSN 0945-6317. eISSN 1432-2307. 2025, vol. 486, iss. 2, p. 287-298. DOI: 10.1007/s00428-024-03737-4. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science), Scopus] [IF: 3.000; AIF: 3.000; Q2 (2025 InCities JCR SCIE)]
2 Žilėnaitė-Petrulaitienė, Dovilė; Rasmusson, Allan; Valkiūnienė, Rūta Barbora; Laurinavičienė, Aida; Petkevičius, Linas; Laurinavičius, Arvydas. Reproducibility of Ki67 Haralick entropy as a prognostic marker in estrogen receptor–positive HER2-negative breast cancer // American journal of clinical pathology. Cary, NC : Oxford University Press. eISSN 1943-7722. 2025, vol. 164, iss. 4, p. 567-580. DOI: 10.1093/ajcp/aqaf081. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science), Scopus]

2024
1 Kielaitė-Gulla, Aistė; Stulpinas, Rokas; Grigonytė, Agnė; Žilėnaitė-Petrulaitienė, Dovilė; Rasmusson, Allan; Laurinavičius, Arvydas; Strupas, Kęstutis. Overall survival prediction by tumor microenvironment lymphocyte distribution in hepatocellular carcinoma after liver transplantation // Journal of surgical research. San Diego, CA : Academic Press Inc Elsevier Science. ISSN 0022-4804. eISSN 1095-8673. 2024, vol. 295, p. 457-467. DOI: 10.1016/j.jss.2023.10.011. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science), Scopus] [IF: 1.700; AIF: 2.300; Q2 (2024 InCities JCR SCIE)]
2 Stulpinas, Rokas; Jakiūnaitė, Ieva; Sidabraitė, Agnė; Rasmusson, Allan; Žilėnaitė-Petrulaitienė, Dovilė; Strupas, Kęstutis; Laurinavičius, Arvydas; Kielaitė-Gulla, Aistė. Low CD8+ density variation and R1 surgical margin as independent predictors of early post-resection recurrence in HCC patients meeting Milan criteria // Current oncology. Basel : MDPI. eISSN 1718-7729. 2024, vol. 31, iss. 9, p. 5344-5353. DOI: 10.3390/curroncol31090394. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science), Scopus]
3 Augulis, Renaldas (tyrėjas); Žilėnaitė-Petrulaitienė, Dovilė (tyrėjas); Rasmusson, Allan (tyrėjas); Valkiūnienė, Rūta Barbora (tyrėjas); Laurinavičienė, Aida (tyrėjas); Petkevičius, Linas (tyrėjas); Laurinavičius, Arvydas (tyrėjas). Ki67 vidunavikinio heterogeniškumo ir CD8 imunogradiento rodiklių rinkinys = A set of Ki67 intratumoral heterogeneity and CD8 immunogradient indicators. Vilnius, 2024. 6 failai. Prieiga per internetą: <https://midas.lt/public-app.html#/research/overview?resourceId=257877&uuid=79146a1b-8674-4413-9068-078cfe2cf939>.
4 Žilėnaitė-Petrulaitienė, Dovilė; Rasmusson, Allan; Valkiūnienė, Rūta Barbora; Laurinavičienė, Aida; Petkevičius, Linas; Laurinavičius, Arvydas. Spatial distributions of CD8 and Ki67 cells in the tumor microenvironment independently predict breast cancer-specific survival in patients with ER+HER2- and triple-negative breast carcinoma // PloS ONE. San Francisco : Public Library Science. eISSN 1932-6203. 2024, vol. 19, iss. 11, art. no. e0314364, p. [1-25]. DOI: 10.1371/journal.pone.0314364. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science), Scopus]
5 Laurinavičius, Arvydas (autorius, išradimo); Rasmusson, Allan (autorius, išradimo); Nestarenkaitė, Aušrinė (autorius, išradimo); Žilėnaitė, Dovilė (autorius, išradimo); Augulis, Renaldas (autorius, išradimo). Automated Tumour-Stroma interface zone detection for anti-tumour response assessment by immunogradient indicators. US12131481B2. 2024-10-29. 22 p. Prieiga per internetą: <https://worldwide.espacenet.com/patent/search/family/070779804/publication/US12131481B2?q=pn%3DUS12131481B2>. [DB: Espacenet]

2023
1 Stulpinas, Rokas; Žilėnaitė-Petrulaitienė, Dovilė; Rasmusson, Allan; Gulla, Aistė; Grigonytė, Agnė; Strupas, Kęstutis; Laurinavičius, Arvydas. Prognostic value of CD8+ lymphocytes in hepatocellular carcinoma and perineoplastic parenchyma assessed by interface density profiles in liver resection samples // Cancers. Basel : MDPI. eISSN 2072-6694. 2023, vol. 15, no. 2, art. no. 366, p. [1-18]. DOI: 10.3390/cancers15020366. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science), Scopus]
2 Stulpinas, Rokas; Žilėnaitė-Petrulaitienė, Dovilė; Rasmusson, Allan; Grigonytė, Agnė; Kielaitė-Gulla, Aistė; Strupas, Kęstutis; Laurinavičius, Arvydas. Computational tissue immune response indicators to predict overall survival in hepatocellular carcinoma // European journal of surgical oncology: ESSO 41 Abstracts 2022. Oxford : Elsevier Science Ltd. ISSN 0748-7983. 2023, vol. 49, iss. 2, p. e164. DOI: 10.1016/j.ejso.2022.11.454. [IF: 3.500; AIF: 3.600; Q1 (2023 InCities JCR SCIE)]

2022
1 Laurinavičius, Arvydas; Rasmusson, Allan; Nestarenkaitė, Aušrinė; Žilėnaitė, Dovilė; Augulis, Renaldas. Automated tumour-stroma interface zone detection for anti-tumour response assessment by immunogradient indicators. EP3953899A1. 2022-02-16. [1] p. Prieiga per internetą: <https://worldwide.espacenet.com/patent/search?q=pn%3DEP3953899A1>.

2021
1 Morkūnas, Mindaugas; Žilėnaitė, Dovilė; Laurinavičienė, Aida; Treigys, Povilas; Laurinavičius, Arvydas. Tumor collagen framework from bright-field histology images predicts overall survival of breast carcinoma patients // Scientific reports. Berlin : Nature research. ISSN 2045-2322. 2021, vol. 11, no. 1, art. no. 15474, p. [1-13]. DOI: 10.1038/s41598-021-94862-6. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science), Scopus, MEDLINE] [IF: 4.997; AIF: 7.694; Q2 (2021 InCities JCR SCIE)]
2 Radžiuvienė, Gedmantė; Rasmusson, Allan; Augulis, Renaldas; Grinevičiūtė, Rūta Barbora; Žilėnaitė, Dovilė; Laurinavičienė, Aida; Ostapenko, Valerijus; Laurinavičius, Arvydas. Intratumoral heterogeneity and immune response indicators to predict overall survival in a retrospective study of HER2-borderline (IHC 2+) breast cancer patients // Frontiers in oncology. Lausanne : Frontiers Research Foundation. ISSN 2234-943X. 2021, vol. 11, art. no. 774088, p. [1-15]. DOI: 10.3389/fonc.2021.774088. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science), Scopus] [IF: 5.738; AIF: 6.352; Q2 (2021 InCities JCR SCIE)]

2020
1 Laurinavičius, Arvydas (autorius, išradimo); Rasmusson, Allan (autorius, išradimo); Nestarenkaitė, Aušrinė (autorius, išradimo); Žilėnaitė, Dovilė (autorius, išradimo); Augulis, Renaldas (autorius, išradimo). Automatizuotas naviko ir stromos sąsajos zonos nustatymas, skirtas naviko atsako įvertinimui naudojant imunogradientinius indikatorius / išradėjai: Arvydas Laurinavičius, Allan Rasmusson, Aušrinė Nestarenkaitė, Dovilė Žilėnaitė, Renaldas Augulis; pareiškėjas: Vilniaus universitetas. LT 6784 B. 2020-12-10. 35 p. Prieiga per internetą: <https://search.vpb.lt/pdb/patent/dossier/2019%20509>. [DB: Lietuvos Respublikos patentų duomenų bazė]
2 Laurinavičius, Arvydas (autorius, išradimo); Rasmusson, Allan (autorius, išradimo); Nestarenkaitė, Aušrinė (autorius, išradimo); Žilėnaitė, Dovilė (autorius, išradimo); Augulis, Renaldas (autorius, išradimo). Automatizuotas naviko ir stromos sąsajos zonos nustatymas, skirtas naviko atsako įvertinimui naudojant imunogradientinius indikatorius / išradėjai: Arvydas Laurinavičius, Allan Rasmusson, Aušrinė Nestarenkaitė, Dovilė Žilėnaitė, Renaldas Augulis; pareiškėjas: Vilniaus universitetas. LT 2019509 A. 2020-10-26. 33 p. Prieiga per internetą: <https://search.vpb.lt/pdb/patent/dossier/2019%20509>.
3 Laurinavičius, Arvydas (autorius, išradimo); Rasmusson, Allan (autorius, išradimo); Nestarenkaitė, Aušrinė (autorius, išradimo); Žilėnaitė, Dovilė (autorius, išradimo); Augulis, Renaldas (autorius, išradimo). Automated tumour-stroma interface zone detection for anti-tumour response assessment by immunogradient indicators / Inventors: Arvydas Laurinavičius, Allan Rasmusson, Aušrinė Nestarenkaitė, Dovilė Žilėnaitė, Renaldas Augulis; applicant: Vilniaus universitetas. WO2020208571A1. 2020-10-15. 36 p. Prieiga per internetą: <https://worldwide.espacenet.com/patent/search/family/070779804/publication/WO2020208571A1?q=pct%2Fib2020%2F053396>. [DB: Espacenet]
4 Rasmusson, Allan; Žilėnaitė, Dovilė; Nestarenkaitė, Aušrinė; Augulis, Renaldas; Laurinavičienė, Aida; Ostapenko, Valerijus; Poškus, Tomas; Laurinavičius, Arvydas. Immunogradient indicators for antitumor response assessment by automated tumor-stroma interface zone detection // American journal of pathology. New York : Elsevier Science Inc. ISSN 0002-9440. eISSN 1525-2191. 2020, vol. 190, no. 6, p. 1309-1322. DOI: 10.1016/j.ajpath.2020.01.018. [DB: Scopus, MEDLINE, Science Citation Index Expanded (Web of Science)] [IF: 4.307; AIF: 3.725; Q2 (2020 InCities JCR SCIE)]
5 Žilėnaitė, Dovilė; Rasmusson, Allan; Augulis, Renaldas; Besusparis, Justinas; Laurinavičienė, Aida; Plancoulaine, Benoit; Ostapenko, Valerijus; Laurinavičius, Arvydas. Independent prognostic value of intratumoral heterogeneity and immune response features by automated digital immunohistochemistry analysis in early hormone receptor-positive breast carcinoma // Frontiers in oncology. Lausanne : Frontiers Research Foundation. ISSN 2234-943X. 2020, vol. 10, art. no. 950, p. [1-13]. DOI: 10.3389/fonc.2020.00950. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science), Scopus] [IF: 6.244; AIF: 6.244; Q2 (2020 InCities JCR SCIE)]

2019
1 Nestarenkaitė, Aušrinė; Rasmusson, Allan; Žilėnaitė, Dovilė; Augulis, Renaldas; Laurinavičienė, Aida; Ostapenko, Valerijus; Poškus, Tomas; Laurinavičius, Arvydas. Prognostic value of CD8 immunogradient indicators in tumour-stroma interface zone of colorectal cancer // Virchows Archiv. Heidelberg : Springer. ISSN 0945-6317. eISSN 1432-2307. 2019, vol. 475, suppl. 1, p. 206-207. DOI: 10.1007/s00428-019-02631-8. [DB: Scopus, Science Citation Index Expanded (Web of Science)] [IF: 2.906; AIF: 2.557; Q2 (2019 InCities JCR SCIE)]
2 Žilėnaitė, Dovilė; Rasmusson, Allan; Nestarenkaitė, Aušrinė; Augulis, Renaldas; Laurinavičienė, Aida; Ostapenko, Valerijus; Poškus, Tomas; Laurinavičius, Arvydas. The immunogradient of CD8+cell density in the tumour-stroma interface zone predicts overall survival of patients with hormone receptor-positive invasive ductal breast carcinoma // Virchows Archiv. Heidelberg : Springer. ISSN 0945-6317. eISSN 1432-2307. 2019, vol. 475, suppl. 1, p. 80-81. DOI: 10.1007/s00428-019-02631-8. [DB: Scopus, Science Citation Index Expanded (Web of Science)] [IF: 2.906; AIF: 2.557; Q2 (2019 InCities JCR SCIE)]

2015
1 Žilėnaitė, Dovilė; Gudavičiūtė, Laura; Laukaitytė, Akvilė; Bikauskaitė, Liucija; Arasimavičius, Justas; Pranckevičienė, Erinija; Kučinskas, Vaidutis. Fenotipo ir genominių sričių sąsajų tyrimams naudojamų bioinformacinių šaltinių apžvalga // Laboratorinė medicina. Vilnius : Lietuvos laboratorinės medicinos draugija. ISSN 1392-6470. 2015, t. 17, nr. 1(65), p. 15-24. [DB: Index Copernicus]