VU Gyvybės mokslų centro autoriaus 'Greta Bigelytė' publikacijų sąrašas

2024
1 Bigelytė, Greta; Duchovska, Brigita; Žedaveinytė, Rimantė; Sasnauskas, Giedrius; Šinkūnas, Tomas; Dalgėdienė, Indrė; Tamulaitienė, Giedrė; Šilanskas, Arūnas; Kazlauskas, Darius; Valančauskas, Lukas; Madariaga-Marcos, Julene; Seidel, Ralf; Šikšnys, Virginijus; Karvelis, Tautvydas. Innate programmable DNA binding by CRISPR-Cas12m effectors enable efficient base editing // Nucleic acids research. Oxford : Oxford University Press. ISSN 0305-1048. eISSN 1362-4962. 2024, vol. 52, iss. 6, p. 3234-3248. DOI: 10.1093/nar/gkae016. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science), Scopus]
2 Marcos, Julene Madariaga; Kauert, Dominik J.; Henkel-Heinecke, Selgar; Irmisch, Patrick; Bigelytė, Greta; Karvelis, Tautvydas; Šikšnys, Virginijus; Seidel, Ralf. Mechanistic insights into CRISPR-Cas12f1 revealed through single-molecule and biochemical studies // Biophysical journal: 68th annual meeting of the Biophysical-Society, Philadelphia, PA, February 10-14, 2024. Cambridge : Cell press. ISSN 0006-3495. eISSN 1542-0086. 2024, vol. 123, iss. 3, suppl. 1, p. 181A-182A. DOI: 10.1016/j.bpj.2023.11.1183. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science)]
3 Van Ginkel, Liz; Lange, Lindsey; Djukanovic, Vesna; Lex, Stephanie; Barone, Pierluigi; Budėnaitė, Laima; Vitkevičienė, Aida; Štitilytė, Miglė; Mabuchi, Megumu; Curcuru, Jennifer L.; Fuchs, Ryan T.; Bigelytė, Greta; Karvelis, Tautvydas; Robb, G. Brett; Gasiūnas, Giedrius; Sander, Jeffry D.; Šikšnys, Virginijus; Young, Joshua K. Engineering miniature SpaCas12f1 genome editing potential // In vitro cellular & developmental biology-animal: 2024 World congress on In vitro biology proceedings. New York : Springer. ISSN 1071-2690. eISSN 1543-706X. 2024, vol. 60, iss. 1, suppl., art. no. P-2028, p. S123-S124. DOI: 10.1007/s11626-024-00962-8. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science)]

2022
1 Henkel-Heinecke, Selgar; Bigelytė, Greta; Karvelis, Tautvydas; Šikšnys, Virginijus; Seidel, Ralf. Dynamics of R-loop formation by CRISPR-Cas12f1 effector complexes // Biophysical journal. Cambridge : Cell Press. ISSN 0006-3495. eISSN 1542-0086. 2022, vol. 121, iss. 3, suppl. 1, p. 477a. DOI: 10.1016/j.bpj.2021.11.375. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science)] [IF: 3.400; AIF: 4.200; Q2 (2022 InCities JCR SCIE)]

2021
1 Bigelytė, Greta; Young, Joshua K; Karvelis, Tautvydas; Budrė, Karolina; Žedaveinytė, Rimantė; Djukanovic, Vesna; Van Ginkel, Elizabeth; Paulraj, Sushmitha; Gasior, Stephen; Jones, Spencer; Feigenbutz, Lanie; Clair, Grace St; Barone, Pierluigi; Bohn, Jennifer; Acharya, Ananta; Zastrow-Hayes, Gina; Henkel-Heinecke, Selgar; Šilanskas, Arūnas; Seidel, Ralf; Šikšnys, Virginijus. Miniature type V-F CRISPR-Cas nucleases enable targeted DNA modification in cells // Nature communications. Berlin : Nature research. eISSN 2041-1723. 2021, vol. 12, iss. 1, art. no. 6191, p. [1-8]. DOI: 10.1038/s41467-021-26469-4. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science), Scopus, PubMed]
2 Karvelis, Tautvydas; Druteika, Gytis; Bigelytė, Greta; Budrė, Karolina; Žedaveinytė, Rimantė; Šilanskas, Arūnas; Kazlauskas, Darius; Venclovas, Česlovas; Šikšnys, Virginijus. Transposon-associated TnpB is a programmable RNA-guided DNA endonuclease // Nature. Berlin : Nature research. ISSN 0028-0836. eISSN 1476-4687. 2021, vol. 599, p. 692-696. DOI: 10.1038/s41586-021-04058-1. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science), Scopus, Academic Search Premier, MEDLINE, Embase] [IF: 69.504; AIF: 7.694; Q1 (2021 InCities JCR SCIE)]

2020
1 Karvelis, Tautvydas; Bigelytė, Greta; Young, Joshua K; Hou, Zhenglin; Žedaveinytė, Rimantė; Budrė, Karolina; Paulraj, Sushmitha; Djukanovic, Vesna; Gasior, Stephen; Šilanskas, Arūnas; Venclovas, Česlovas; Šikšnys, Virginijus. PAM recognition by miniature CRISPR-Cas12f nucleases triggers programmable double-stranded DNA target cleavage // Nucleic acids research. Oxford : Oxford University Press. ISSN 0305-1048. eISSN 1362-4962. 2020, vol. 48, iss. 9, p. 5016-5023. DOI: 10.1093/nar/gkaa208. [DB: Scopus, Science Citation Index Expanded (Web of Science)] [IF: 16.971; AIF: 5.817; Q1 (2020 InCities JCR SCIE)]
2 Gasiunas, Giedrius; Young, Joshua K; Karvelis, Tautvydas; Kazlauskas, Darius; Urbaitis, Tomas; Jasnauskaite, Monika; Grusyte, Mantvyda M; Paulraj, Sushmitha; Wang, Po-Hao; Hou, Zhenglin; Dooley, Shane K; Cigan, Mark; Alarcon, Clara; Chilcoat, N Doane; Bigelytė, Greta; Curcuru, Jennifer L; Mabuchi, Megumu; Sun, Zhiyi; Fuchs, Ryan T; Schildkraut, Ezra; Weigele, Peter R; Jack, William E; Robb, G Brett; Venclovas, Česlovas; Šikšnys, Virginijus. A catalogue of biochemically diverse CRISPR-Cas9 orthologs // Nature communications. London : Nature Publishing Group. eISSN 2041-1723. 2020, vol. 11, no. 1, art. no. 5512, p. [1-10]. DOI: 10.1038/s41467-020-19344-1. [DB: Scopus, Science Citation Index Expanded (Web of Science)]

2018
1 Bigelytė, Greta; Karvelis, Tautvydas; Gasiūnas, Giedrius; Young, Joshua K.; Šilanskas, Arūnas; Cigan, Mark; Šikšnys, Virginijus. A rapid method for the identification of protospacer adjacent motifs and guide RNAs for novel Cas9 orthologs // Vita Scientia : international conference, 3rd January 2018, Vilnius : conference book. Vilnius : Vita Scientia. ISSN 2538-791X. 2018, p. 27. Prieiga per internetą: <http://www.vitascientia.lt/book> [žiūrėta 2018-04-19].

2017
1 Karvelis, Tautvydas; Gasiūnas, Giedrius; Bigelytė, Greta; Šikšnys, Virginijus. Naujų Cas9 endonukleazių charakterizavimas ir pritaikymas genomo redagavimui // Fizinių ir technologijos mokslų tarpdalykiniai tyrimai : 7-oji jaunųjų mokslininkų konferencija, 2017 m. vasario 9 d. : pranešimų santraukos. Vilnius : Lietuvos mokslų akademijos leidykla. 2017, p. 18-19. Prieiga per internetą: <http://mail.ma.lt/components/com_rseventspro/assets/images/files/2017-02-09_JMK_pranesimu_santraukos_galutines.pdf> [žiūrėta 2017-06-08].
2 Bigelytė, Greta; Šilanskas, Arūnas; Karvelis, Tautvydas; Gasiūnas, Giedrius. Naujų CRISPR-Cas9 baltymų PAM sekos charakterizavimas // Bioateitis: gamtos ir gyvybės mokslų perspektyvos : 10-oji jaunųjų mokslininkų konferencija, 2017 m. gruodžio 7 d.: pranešimų santraukos. Vilnius : Lietuvos mokslų akademijos leidykla. 2017, p. 21. Prieiga per internetą: <http://www.lma.lt/uploads/2017-12-07_BIOATEITIS_pranesimu_santraukos.pdf> [žiūrėta 2018-03-27].

2016
1 Karvelis, Tautvydas; Gasiūnas, Giedrius; Young, Joshua; Bigelytė, Greta; Šilanskas, Arūnas; Cigan, Mark; Šikšnys, Virginijus. Rapid characterization of CRISPR-Cas9 protospacer adjacent motif (PAM) sequence elements // XIVth International Conference of the Lithuanian Biochemical Society : the program and abstract book. Vilnius : Lithuanian Biochemical Society. 2016, p. 44. Prieiga per internetą: <https://cloudup.com/itEl9IF2n8q> [žiūrėta 2018-03-14].

2015
1 Karvelis, Tautvydas; Gasiūnas, Giedrius; Young, Joshua; Bigelytė, Greta; Šilanskas, Arūnas; Cigan, Mark; Šikšnys, Virginijus. Rapid characterization of CRISPR-Cas9 protospacer adjacent motif sequence elements // Genome biology. London : BioMed Central Ltd. ISSN 1465-6906. eISSN 1474-760X. 2015, vol. 16, art. no. 253, p. [1-13]. DOI: 10.1186/s13059-015-0818-7. [DB: Science Citation Index Expanded (Web of Science), BIOSIS Previews, Current Contents, Scopus, MEDLINE, CAB Abstracts] [IF: 11.313; AIF: 3.724; Q1 (2015 InCities JCR SCIE)]